Magdalena Czachorowska urodziła się w Bydgoszczy i tu w latach 1984-1989 studiowała na kierunku filologia polska w Wyższej Szkole Pedagogicznej. Pracę magisterską napisała pod kierunkiem prof. dra hab. Leszka Moszyńskiego. Efektem dalszej współpracy z prof. L. Moszyńskim była praca doktorska pt. "System antroponimiczny Wielkopolskich rot sądowych XIV i XV w." obroniona na Uniwersytecie Gdańskim w 1997 r., opublikowana w następnym roku przez Wydawnictwo Uczelniane Wyższej Szkoły Pedagogicznej w Bydgoszczy. Habilitacje uzyskała w 2007 r. w Instytucie Slawistyki Polskiej Akademii Nauk w Warszawie na podstawie monografii "Wyobraźnia pisarska Bolesława Prusa i Stefana Żeromskiego na przykładzie słownictwa topograficznego i nazw barw", opublikowanej w Bydgoszczy w 2006 r.

Jej zainteresowania badawcze koncentrują się wokół zagadnień z onomastyki (antroponimia, toponimia, chrematonimia, nazewnictwo miejskie, etymologia naukowa i ludowa nazw własnych), historii języka polskiego (pisownia, fonetyka, grafia, ortografia, leksyka), stylistyki, leksykologii, języka osobniczego. Jest autorką 8 monografii (w tym dwóch we współautorstwie, licznych artykułów i recenzji.

Od 1 maja 2008 r. pełniła funkcję dyrektora Instytutu Filologii Polskiej i Kulturoznawstwa Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy. Była członkiem Komisji Oceniającej, Komisji ds. Nauki, Komisji Wydawniczej Wydziału Humanistycznego Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego, członkiem Senatu UKW od 2016 r., a w czerwcu 2017 r. została wybrana do kapituły Medalu Kazimierza Wielkiego Casimirus Magnus. Wielokrotnie nagradzana była przez Rektora UKW za osiągnięcia naukowe i organizacyjne, otrzymała także Medal Komisji Edukacji Narodowej. Od tego roku akademickiego, jak już wyżej zaznaczyłem, pełni funkcję Dziekana Wydziału Językoznawstwa.

Dnia 25 października 2019 r. Prezydent RP Andrzej Duda nadał Magdalenie Czachorowskiej tytuł profesora nauk humanistycznych.