Przeprowadzone postępowanie kontrolne dotyczy okresu lat 2011-2013. Główny zarzut dotyczy naruszenia tzw. zasady bliskości przy zlecaniu odbioru oraz utylizacji powstałych odpadów medycznych. Zasada bliskości zapisana w przepisach o ochronie środowiska mówi, że odpady w pierwszej kolejności powinny być unieszkodliwiane w miejscu ich powstania. Kontrolerzy NIK stwierdzili, że szpital instalacji do utylizacji nie posiadał i pomimo zaleceń kontrolnych, nie została ona utworzona.

Drugi poważny zarzut dotyczy corocznego przekraczania ustalonego decyzją administracyjną limitu odpadów medycznych. Mniejsze uchybienia stwierdzone przez NIK dotyczącą m.in.: przechowywania ponad dozwolony termin niebezpiecznych substancji w szpitalnych magazynach i korzystania do wewnątrzszpitalnego transportu ze źle skonstruowanego wózka.