Generalna Dyrekcja Dróg Krajowych i Autostrad jako inwestor o decyzję środowiskową – za pośrednictwem wykonawcy studium techniczno-ekonomiczno-środowiskowego – wniosła 31 stycznia 2019 roku. Regionalna Dyrekcja Ochrony Środowiska w Bydgoszczy tę decyzję wydała w lutym 2020 roku. Do tej decyzji wpłynął szereg odwołań, głównie organizacji ekologicznych i ruchów miejskich, którzy uważali, że w tym wariancie droga będzie za bardzo ingerować w ekosystem Puszczy Bydgoskiej. Wydłużyło to znacznie postępowanie, dopiero w czerwcu 2021 roku Generalny Dyrektor Ochrony Środowiska w Warszawie wydał ostateczną decyzję, co pozwoliło kilka tygodni później ogłosić pierwsze przetargi.

Organizacje niezadowolone z decyzji GDOŚ, których uwagi nie zostały uwzględnione, zaskarżyły decyzję środowiskową do sądu. Nie wstrzymało to postępowania inwestycyjnego, ale gdyby sąd uznał te roszczenia, wówczas inwestycja mogłaby nawet stanąć w miejscu. Sąd odrzucił jednak te roszczenia.