Arcybiskup Lenga Ojca Świętego nie nazywa Franciszkiem, ale wprost mówi o nim Bergolio (nazwisko jakie używał Franciszek przed zostaniem papieżem),co ma podkreślać, że nie uznaje go jako zwierzchnika Kościoła katolickiego. Zdaniem abp. Lengi papież nie służy Jezusowi Chrystusowi,ale realizuje agendę ONZ i masonów - Ty stwarzasz nowy Kościół. I wyrzucasz z Kościoła tych co do niego należą od Pana Jezusa Chrystusa do apostołów – zwracał się do papieża abp Lenga, podczas spotkania otwartego w Bydgoszczy - Bergolio idzie śliską drogą do zatracenia

Zdaniem abp. Lengi papież stara się wdrażać do Kościoła ideę New Age. Oberwało się też prawie wszystkim biskupom i arcybiskupom, że w tym procederze ,,niszczenia Kościoła” uczestniczą. Padło nawet sformułowanie, że robią to dla ziemskich korzyści.

Powyższe wypowiedzi można uznać jako buntowanie się przeciwko Watykanowi, co w praktyce jest nawoływaniem do schizmy. Abp. Lenga wprost mówił, że on schizmatykiem nie jest, natomiast publicznie heretykiem i schizmatykiem nazwał Bergolio, czyli papieża Franciszka.

- Bergolio nie słucha Chrystusa. Mam prawo jego słuchać czy nie? Święty Bellarmin mówił, że jeżeli nawet papież uczestniczy w niszczeniu Kościoła to go nie wolno słuchać. Bergolio jeszcze nie jest święty – wskazywał abp. Lenga.

Stanowisko diecezji wobec poglądów i tez głoszonych przez abpa jest jednoznaczne i nie odbiega od stanowiska Konferencji Episkopatu Polski. Abp Lenga nie reprezentuje Kościoła w Polsce i tym samym Kościoła Katolickiego w Bydgoszczy, a głoszone przez Niego tezy wynikają z błędnego rozumienia eklezjologii i prakseologii duszpasterskiej – odnosi się do sobotniego spotkana ks. Marcin Jiers, rzecznik diecezji bydgoskiej - Kodeks Prawa Kanonicznego mówi jasno: Biskup Rzymski pełni najwyższą i pełną władzę w Kościele, wobec której wszyscy pasterze jak i wierni, bez względu na miejsce w hierarchii, osobiście i wraz z innymi, zobowiązani są okazać podporządkowanie jurysdykcyjne i posłuszeństwo, nie tylko w tym co dotyczy wiary i obyczajów, ale także w tym, co odnosi się do dyscypliny i prawa Kościoła – por. Konst. Soboru Watykańskiego II Pastor aeternus, wypowiedzi soboru Lyońskiego, Wyznanie Wiary Michała Paleologa, Sobór Florencki, Kodeks Prawa Kanonicznego kan. 331.

Do 2011 roku abp. Jan Paweł Lenga kierował diecezją w Kazachstanie. W 2011 roku został od funkcji i skierowany przez Watykan do przebywania w Licheniu. Bp. Wiesław Mering, któremu podlega diecezja włocławka, odsunął go od publicznego głoszenia kazań.