Powyższe zapisy uchwały z grudnia 2018 roku (ustalającej regulamin BBO) zaskarżył wojewoda. Wojewódzki Sąd Administracyjny uznał zapisy mówiące, że osoby zgłaszające projekty lub biorące udział w głosowaniu muszą mieć ukończony 16. rok życia za niezgodne z polskim prawem, tym samym usuwając je z obiegu.

W praktyce sąd zniósł ten zapis, tym samym prawo do udziału w Bydgoskim Budżecie Obywatelskim mają także osoby z ograniczoną zdolnością do czynności prawnej, czyli także 13. latkowie oraz starsi nastolatkowie. Bydgoski sąd opierając się o orzeczenie łódzkiego sądu wyszedł z założenia, że konsultacje społeczne nie są przecież wiążące dla władzy, a mają jedynie na celu umożliwienie się rządzącym z opiniami społeczeństwa. BBO to w praktyce są właśnie konsultacje społeczne, choć ma miejsce niepisana umowa, że koalicją rządząca wybrane w głosowaniu inwestycje uwzględnia w dokumentach budżetowych.

Zdaniem Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego, bydgoska Rada Miasta w 2018 roku wyszła poza swoje kompetencję, czym naruszyła artykuł 7 Konstytucji.

Radni w międzyczasie zmienili zasady

W czerwcu 2021 roku, gdy prowadzone było już postępowanie sądowe - Rada Miasta Bydgoszczy zmieniła uchwałę z 2018 roku, wprowadzając zapisy, które umożłiwiają udział w BBO każdemu mieszkańcowi Bydgoszczy, bez względu na ograniczenia wiekowe.