W 2020 roku na sprzedaży usług Port Lotniczy Bydgoszcz zarobił nieco ponad 13,2 mln zł, gdy rok wcześniej było to prawie 19,4 mln zł. Udało się co prawda w ubiegłym roku koszty działalności operacyjnej obniżyć do 24,3 mln zł z ponad 29,7 mln zł, ale ostateczny rozrachunek to wyższa strata operacyjna o około 1,8 mln zł niż to było w roku 2019, uznawanym za najlepszy w historii, za sprawą rekordowej liczby obsłużonych pasażerów.

Jesienią 2020 roku Sejmik Województwa wyraził zgodę na dokapitalizowanie lotniska przez Województwo Kujawsko-Pomorskie kwotą 12 mln zł. Również we wrześniu bieżącego roku przewidziano dokapitalizowanie lotniska, ale tym razem kwotą 3 mln zł.

W 2020 roku pierwsze tygodnie były dobre dla bydgoskiego lotniska, pozwalające myśleć nawet o próbie zbliżenia się do obsłużenia 0,5 mln pasażerów. Pandemia sprawiła, że w marcu loty zostały zawieszone – dopiero po kilku tygodniach powróciła częściowa siatka połączenia PLL LOT i RyanAir, aby późną jesienią znowu być zawieszona. Codzienne loty Lufthansy do Frankfurtu nie powróciły do dzisiaj.