Kontrolerzy NIK ustalili, że w roku szkolnym 2015/2016 stwierdzono 20 przypadków naruszenia artykułu 67 ustawy o systemie oświaty, która nakazywała, iż pod nadzorem jednego opiekuna może znajdować się maksymalnie 25 uczniów.

Pozostałe dwa stwierdzone uchybienia dotyczą kwestii formalnych. W roku szkolnym 2014/2015 nie odnotowywano w dzienniku świetlicy Szkoły obecności uczniów na poszczególnych godzinach zajęć. To zdaniem NIK naruszyło jedno z rozporządzeń Ministra Edukacji Narodowej z 2014 roku. Zdaniem dyrekcji szkoły, godziny wejścia i wyjścia uczniów do świetlicy były zapisywane osobnym zeszycie. Jednakże sama dyrekcja uznała, że praktyki te były nie do końca właściwe, stąd też zdecydowano się je poprawić. Trzecie uchybienie dotyczy nieuwzględniania, również w roku szkolnym 2014/2015 wydatków rzeczowych na funkcjonowanie świetlicy w wydatkach szkoły. Dyrekcja tłumaczy to faktem, że wszystkie wydatki szkoły traktowano jako jedną całość. Taki sam pogląd wyraził prezydent Inowrocławia, któremu podlega szkoła. Najwyższa Izba Kontroli odrzuca jednak te usprawiedliwienia.

W wystąpieniu pokontrolnym NIK wskazuje na konieczność poprawienia obu kwestii w przyszłości, bowiem problem z ewidencją obecności uczniów szkoła już wcześniej sama wyeliminowała.