Most Uniwersytecki został wybudowany przy wsparciu środkami unijnymi z Regionalnego Programu Operacyjnego na lata 2007-2013. Głównym celem projektu było połączenie ulicy Powstańców Wielkopolskich ze Wzgórzem Wolności. W ramach tego zadania wykonano też inne inwestycje, jak przebudowa torowisk tramwajowych, czy budowa ścieżek rowerowych. Wartość całego projektu to 218,4 mln zł.

Jednym ze wskaźników do osiągnięcia przy tej inwestycji miało być wybudowanie 1,58 km dróg powiatowych. Rozporządzenie Rady (WE) nr 1083/2006 narzuca obowiązek trwałości wskaźników projektu, który wynosi 5 lat. Po namowach jednego z wicemarszałków zdecydowano, że od 1 stycznia odcinek pomiędzy ulicami Powstańców Wielkopolskich i Wojska Polskiego będzie miał status drogi wojewódzkiej, czyli jej właścicielem nie będzie już Miasto Bydgoszcz ale Samorząd Województwa. Nasuwa się obawa, że Unia Europejska może nie uznać trwałości tego projektu i wezwać Bydgoszcz do zwrotu dotacji, co będzie poważnym uszczerbkiem dla budżetu miasta.

Nie udało nam się odnaleźć jednoznacznych orzeczeń dla tego typu przypadków. Osoby zajmujące się funduszami unijnymi nie kryją jednak obaw, co do prawidłowego rozliczenia inwestycji w tym stanie prawnym.