Nie ma jednoznacznej opinii historyków, kiedy dokładnie kościół został zbudowany, są nawet hipotezy o pierwszej połowie XI wieku. Do XIV wieku kościół podlegał pod parafię św. Marii Magdaleny w Wyszogrodzie. W późniejszych wiekach służył on bernardynom, stąd też nazwa ronda oraz ulicy obok poprowadzonej (Bernardyńskiej). To właśnie konieczność budowy traktu, dzisiejszej Bernardyńskiej sprawił, że w 1879 roku kościół został rozebrany.

Do tej pory nie przeprowadzono jednak gruntowniejszych badań pozostałości po tym kościele. Przy okazji trwających prac inwestycyjnych jest ku temu okazja. Obok kościoła funkcjonował cmentarz, ale ten teren nie będzie objęty badaniami.

Zdjęcie z 1875 roku